Проф. д-р М. Мурат Наки родился в городе Карс, Турция. Начальное образование он начал в Карсе, а среднее и старшее школьное образование получил в Анатолийском лицее Эрзурума. В 1991 году поступил на медицинский факультет Стамбульского университета.
После завершения медицинского образования он начал ординатуру по акушерству и гинекологии в Учебно-исследовательской больнице Гёзтепе, успешно сдав экзамен на медицинскую специализацию (TUS). В течение пяти лет работы старшим ординатором он проходил стажировку в качестве клинического наблюдателя и исследователя на кафедре гинекологической онкологии медицинского факультета Стамбульского университета Джеррахпаша, а также в онкологическом центре Memorial Sloan-Kettering в Нью-Йорке.
Позднее он продолжил свою научную и клиническую деятельность в Учебно-исследовательской больнице имени д-ра Лютфи Кырдара в Картале. Успешно сдав экзамен Министерства здравоохранения, он был назначен заведующим клиникой и основал отделение акушерства и гинекологии в Учебно-исследовательской больнице Багджылар.
В 2011 году он получил субспециализацию по направлению «Хирургия гинекологической онкологии» в рамках программы сертификации Министерства здравоохранения. Подготовив множество ординаторов в различных учреждениях, где он работал, проф. д-р Наки успешно сдал экзамен на доцентуру и в 2012 году получил звание доцента университета.
Проф. д-р М. Мурат Наки выполнил многочисленные операции в области гинекологической онкологии и является одним из немногих специалистов, выполняющих операции при гинекологических раках с применением малоинвазивных (лапароскопических) методов. Он является первым хирургом в Турции, использовавшим 3D-лапароскопию. Кроме того, он входит в число немногих «консольных» хирургов, работающих с передовой системой роботизированной хирургии da Vinci.
Известный своими научными исследованиями и работами в области гинекологических онкологических заболеваний, проф. д-р Наки также продолжает научную деятельность в области доброкачественных гинекологических заболеваний и ведения беременности. В настоящее время он принимает пациентов в своей частной клинике в районе Нишанташы, Стамбул.
Его цель — достойно представлять свою страну на мировом уровне в области гинекологической онкологии и предоставлять пациентам современные методы диагностики и лечения с использованием передовых технологий.